【公開日：2024.07.25】【最終更新日：2024.04.11】
課題データ / Project Data
課題番号 / Project Issue Number
23KT1285
利用課題名 / Title
シングルセル解析による環境毒性研究
利用した実施機関 / Support Institute
京都大学 / Kyoto Univ.
機関外・機関内の利用 / External or Internal Use
内部利用（ARIM事業参画者以外）/Internal Use (by non ARIM members)
技術領域 / Technology Area
【横断技術領域 / Cross-Technology Area】（主 / Main）加工・デバイスプロセス/Nanofabrication（副 / Sub）-
【重要技術領域 / Important Technology Area】（主 / Main）マルチマテリアル化技術・次世代高分子マテリアル/Multi-material technologies / Next-generation high-molecular materials（副 / Sub）-
キーワード / Keywords
シングルセル解析,環境汚染物質,培養細胞,実験動物,リソグラフィ/ Lithography,流路デバイス/ Fluidec Device,光リソグラフィ/ Photolithgraphy,3D積層技術/ 3D lamination technology
利用者と利用形態 / User and Support Type
利用者名（課題申請者）/ User Name (Project Applicant)
松田 知成
所属名 / Affiliation
京都大学 大学院工学研究科
共同利用者氏名 / Names of Collaborators in Other Institutes Than Hub and Spoke Institutes
西嶋 優輝,小林 勇毅
ARIM実施機関支援担当者 / Names of Collaborators in The Hub and Spoke Institutes
岸村眞治
利用形態 / Support Type
（主 / Main）機器利用/Equipment Utilization（副 / Sub）,技術補助/Technical Assistance
利用した主な設備 / Equipment Used in This Project
KT-103：レーザー直接描画装置
KT-119：両面マスク露光&ボンドアライメント装置
KT-230：UVオゾンクリーナー・キュア装置
報告書データ / Report
概要（目的・用途・実施内容）/ Abstract (Aim, Use Applications and Contents)
シングルセルRNA sequencingは、今や生物学の必須技術となっている。本研究では、様々な環境汚染物質が、培養細胞や、実験動物の細胞集団に与える影響を、シングルセルRNA sequencingにより解明することを目的とする。このために、ドロップレットを生成するマイクロ流路や、細胞をドロップレットに封入するためのマイクロ流路、および、その他、環境毒性学研究に有用なマイクロ流路を開発する。
実験 / Experimental
文献の設計図に従って、京大ナノハブの装置（KT-103：レーザー直接描画装置、KT-119:：両面マスク露光&ボンドアライメント装置）を用いて、シングルセルRNA sequencingに使用するマイクロ流路を作成し、ドロップレット作成が可能か確認した。
結果と考察 / Results and Discussion
マイクロ流路は、設計よりも若干薄いものができたが、研究室に持ち帰り、シリンジポンプを接続してドロップレットの作成を行なった結果、想定サイズよりもやや小さなドロップレットが形成された。サイズの違いは許容範囲内であり、これを用いてシングルセル解析を進めている。
図・表・数式 / Figures, Tables and Equations
その他・特記事項（参考文献・謝辞等） / Remarks(References and Acknowledgements)
参考文献：Single-cell barcoding and sequencing using droplet microfluidics, Nature Protocols, volume 12, pages44–73 (2017)
成果発表・成果利用 / Publication and Patents
論文・プロシーディング（DOIのあるもの） / DOI (Publication and Proceedings)
口頭発表、ポスター発表および、その他の論文 / Oral Presentations etc.
特許 / Patents
特許出願件数 / Number of Patent Applications：0件
特許登録件数 / Number of Registered Patents：0件