利用報告書 / User's Report | ARIM Japan公式ホームページ_マテリアル先端リサーチインフラ

【公開日：2023.07.31】【最終更新日：2023.04.27】

課題データ / Project Data

課題番号 / Project Issue Number

22UE0028

利用課題名 / Title

創薬システムエンジニアリング

利用した実施機関 / Support Institute

電気通信大学

機関外・機関内の利用 / External or Internal Use

内部利用（ARIM事業参画者以外）/Internal Use (by non ARIM members)

技術領域 / Technology Area

【横断技術領域 / Cross-Technology Area】（主 / Main）物質・材料合成プロセス/Molecule & Material Synthesis（副 / Sub）計測・分析/Advanced Characterization

【重要技術領域 / Important Technology Area】（主 / Main）次世代バイオマテリアル/Next-generation biomaterials（副 / Sub）-

キーワード / Keywords

covalent aptamer, middle-molecule covalent drug, peptide/oligonucleotide therapeutics, pharmacokinetic parameter, quiescent affinity label, targeted covalent inhibitor (TCI), bioTCI, midTCI,核磁気共鳴/Nuclear magnetic resonance,質量分析/Mass spectrometry,核磁気共鳴/Nuclear magnetic resonance,質量分析/Mass spectrometry,バイオセンサ/ Biosensor

利用者と利用形態 / User and Support Type

利用者名（課題申請者）/ User Name (Project Applicant)

瀧真清

所属名 / Affiliation

電気通信大学情報理工学研究科

共同利用者氏名 / Names of Collaborators in Other Institutes Than Hub and Spoke Institutes

勝木　陸,阿部峻士,田島　慶人,市川　裕貴

ARIM実施機関支援担当者 / Names of Collaborators in The Hub and Spoke Institutes

桑原大介,北田昇雄,松橋千尋

利用形態 / Support Type

（主 / Main）機器利用/Equipment Utilization（副 / Sub）-

利用した主な設備 / Equipment Used in This Project

UE-003：溶液NMR装置
 UE-013：ESI-TOF型質量分析計
 UE-019：MALDI-スパイラルTOF 質量分析装置

報告書データ / Report

概要（目的・用途・実施内容）/ Abstract (Aim, Use Applications and Contents)

コンビナトリアル化学的に探索を行った中分子型分子標的性ペプチド、および中分子型targeted covalent inhibitor (TCI)を作製し、それらの高い分子標的性や標的阻害持続性などの物性評価を行った。

実験 / Experimental

中分子型分子標的性ペプチド、および中分子型TCIを合成した後の化合物同定の際には、NMR測定装置（UE-003）、および質量分析装置（UE-013およびUE-019）を日常的に使用している。

結果と考察 / Results and Discussion

中分子型TCIの際には、標的蛋白質以外への不可逆的な共有結合を最小限化するために、SuFEx反応性を有する新たな共有結合開始起点（warhead）分子の有機合成の開発を種々行ったが、その際にNMR測定装置（UE-003）を用いた諸核種（¹H, ¹³C, ¹⁹F）でのスペクトル挙動から、有用な知見が得られている。そのような低分子化合物をペプチドに組み込んで中分子型TCIを作製した時点でも、MSスペクトルおよびMS/MSスペクトルの測定を行う必要があるが、質量分析装置（UE-019）を用いることで、明快に構造決定がなされている。詳細は、以下の原著論文に記載を行った。

図・表・数式 / Figures, Tables and Equations

その他・特記事項（参考文献・謝辞等） / Remarks(References and Acknowledgements)

原著論文のDOI：10.1007/s00216-022-04128-xおよび10.3390/ijms23147778(詳細は成果発表・成果利用データのDOIを参照)

成果発表・成果利用 / Publication and Patents

論文・プロシーディング（DOIのあるもの） / DOI (Publication and Proceedings)

Yudai Tabuchi, Relative Nuclease Resistance of a DNA Aptamer Covalently Conjugated to a Target Protein, International Journal of Molecular Sciences, 23, 7778(2022).
DOI: 10.3390/ijms23147778
Riku Katsuki, Solvatochromic peptidic binder obtained via extended phage display acts as a fluororeporter for fragment-based drug discovery (FBDD), Analytical and Bioanalytical Chemistry, 414, 4803-4807(2022).
DOI: 10.1007/s00216-022-04128-x
Jay Yang, bioTCIs: Middle-to-Macro Biomolecular Targeted Covalent Inhibitors Possessing Both Semi-Permanent Drug Action and Stringent Target Specificity as Potential Antibody Replacements, International Journal of Molecular Sciences, 24, 3525(2023).
DOI: 10.3390/ijms24043525

口頭発表、ポスター発表および、その他の論文 / Oral Presentations etc.

特許 / Patents

特許出願件数 / Number of Patent Applications：0件
特許登録件数 / Number of Registered Patents：0件